Schon vor einiger Zeit hat sich die Ordensgemeinschaft die Frage gestellt, wie sie ihr Lebenswerk erhalten kann, wenn die Anzahl der Ordensbrüder künftig weiter abnimmt. Im Jahr 2013 gründete sie die Stiftung der Alexianerbrüder, die seither die frühere Gesellschafterrolle des Ordens in der Alexianer GmbH übernimmt. Damit einher ging auch die Trennung der Vermögensverhältnisse: Die Dachgesellschaft Alexianer GmbH mit allen ihren Einrichtungen sowie die Stiftung sind juristisch und finanziell selbstständig.

Neben der Gesellschafterfunktion hat die Stiftung die Aufgabe, das geistige, kulturelle und religiöse Wirken der Ordensgemeinschaft der Alexianerbrüder weltweit zu fördern und zu sichern. Darüber hinaus entscheidet sie über die Verwendung der Erträge, stellt einen Wirtschaftsplan auf und bewirtschaftet das Stiftungsvermögen. Das Kuratorium besteht aus Ordensleuten und aus weltlichen Mitgliedern.